خالص سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس

Authors

آرمین آذرفر

کرامت اله ایزدپناه

علیرضا افشاریفر

محمود معصومی

abstract

ویروس موزائیک زرد کدو (zucchini yellow mosaic virus) ازنمونه­های کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به عنوان جدایه فارس این ویروس ((zymv-f به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. zymv-f در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافت­های آلوده برای خالص­سازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتی­سرمبه دست آمده از آموده خالص ویروس، در آزمون­های سرولوژیکی استفاده شد. با بهره­گیری از روش به دام اندازی آر اِن اِی پیک و آغازگرهای اختصاصی طراحی شده، واکنش ترانویسی معکوس و زنجیره­ای پلی­مراز (rt-pcr) انجام شد و دی اِن اِی های تکثیر شده، همسانه سازی و تعیین ترادف شدند. با تجمیع ترادف­های به دست آمده، ترادف کامل ژنوم zymv-f شامل 9591 نوکلئوتید (رس­شمار jn183062 در بانک ژن) به دست آمد. آنالیزهای فیلوژنتیکی براساس ترادف نوکلئوتیدی و آمینو اسیدی ژنوم کامل و هر کدام از ژن­ها به طور انفرادی نشان داد که zymv-f بیشترین شباهت را به جدایه­های اسرائیل و اسلواکی zymv دارد. هم چنین بر اساس ترادف قسمتی از ژن پروتئین پوششی، مشخص شد که جدایه­های ویروس در ایران در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی شباهت زیادی به هم دارند و جدایه فارس و کرج در یک گروه قرار می­گیرند. این اولین گزارش از تعیین ترادف کامل ژنوم zymv در ایران و دومین گزارش از منطقه خاور میانه و نزدیک است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

خالص‌سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس

ویروس موزائیک زرد کدو (Zucchini yellow mosaic virus) ازنمونه‌های کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به‌عنوان جدایه فارس این ویروس ((ZYMV-F به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. ZYMV-F در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافت‌های آلوده برای خالص‌سازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتی‌سرمب...

full text

تعیین ترادف نوکلئوتیدی کامل ژنوم ویروس موزاییک کوتولگی ذرت (mdmv)

ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (maize dwarf mosaic virus, mdmv) از نظر اقتصادی در سطح جهانی یکی از مهم ترین ویروس های ذرت به شمار می آید. در ایران نیز این ویروس از اهمیت زیادی برخوردار است. هدف از انجام این تحقیق تعیین ترادف کامل ژنوم ویروس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده و مقایسه آن با سایر ترادف های پوتی ویروسهای گرامینه موجود در بانک ژن بود. پس از انجام rt-pcr قطعات بدست آمده همسانه ساز...

15 صفحه اول

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ویروس موزائیک جنوبی مرغ بر اساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه ´۳ ژنوم

ویروس موزائیک جنوبی مرغ (bermuda grass southern mosaic virus, bgsmv)، فراوان ترین ویروس مولد موزائیک در مرغ در نواحی گرمسیری جنوب ایران می باشد. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی bgsmv، گیاهان مرغ با علائم موزائیک از جیرفت، بوشهر، برازجان، رامهرمز، اندیمشک، شوشتر، بهبهان و داراب جمع آوری و ناحیه ´3 ژنوم آنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی این ویروس با روش rt-pcr تکثیر و همسانه سازی شد. ناحیه cp-utr ا...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ویروس موزائیک جنوبی مرغ بر اساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه ´3 ژنوم

ویروس موزائیک جنوبی مرغ (bermuda grass southern mosaic virus, bgsmv)، فراوان­ترین ویروس­ مولد موزائیک در مرغ در نواحی گرمسیری جنوب ایران می­باشد. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی bgsmv، گیاهان مرغ با علائم موزائیک از جیرفت، بوشهر، برازجان، رامهرمز، اندیمشک، شوشتر، بهبهان و داراب جمع آوری و ناحیه ´3 ژنوم آنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی این ویروس با روش rt-pcr تکثیر و همسانه سازی شد. ناحیه cp-utr ...

full text

آنالیز ترادف نوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت و بررسی منشاء و تکامل آن

ترادف کاملنوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus MDMV-Ir) تعیین گردید. ژنوم ویروس بجز دنباله Poly A انتهایی ʹ3، 9499 نوکلئوتید بود که شامل 139 نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ 5 و 234 نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ 3 و یک چارچوب باز خواندنی که یک پلی پروتئین با 3042 اسید آمینه را کد می کند را شامل می شد. MDMV-Ir  با سایر جدایه های ویروس4/86 تا 9/91 در‌صد شباهت...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های ویروس موزائیک جنوبی مرغ بر اساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه ´3 ژنوم

ویروس موزائیک جنوبی مرغ (Bermuda grass southern mosaic virus, BgSMV)، فراوان‌ترین ویروس‌ مولد موزائیک در مرغ در نواحی گرمسیری جنوب ایران می‌باشد. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی BgSMV، گیاهان مرغ با علائم موزائیک از جیرفت، بوشهر، برازجان، رامهرمز، اندیمشک، شوشتر، بهبهان و داراب جمع‌آوری و ناحیه ´3 ژنوم آنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی این ویروس با روش RT-PCR تکثیر و همسانه‌سازی شد. ناحیه CP-UTR ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
بیماریهای گیاهی

Publisher: انجمن بیماری شناسی گیاهی ایران

ISSN 2774-0006

volume 48

issue 2 2012

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023